Ngày 25 tháng 9 năm 2006, Wikimedia công bố chọn Đài Bắc làm nơi tổ chức Wikimania lần thứ ba. Đây là phần thưởng xứng đáng cho cộng đồng Wikipedian Đài Loan khi đưa phiên bản tiếng Hoa lên vị trí thứ 12 trong bảng xếp hạng những phiên bản ngôn ngữ thuộc Wikipedia.

Cạnh tranh giành quyền đăng cai lần này với Đài Bắc ở vòng lựa chọn cuối cùng còn có London, Alexandria (Ai Cập) và Torino (Ý). Các thành phố khác là Hồng Kông, Singapore, Istanbul (Thổ Nhĩ Kỳ) và Orlando, Florida đã không vượt qua được vòng bỏ phiếu đầu tiên. Các cộng đồng wiki tại Genève (Thụy Sĩ), Chicago, Illinois và Las Vegas, Nevada cũng có ý định xin đăng cai nhưng cuối cùng vẫn không thấy đăng ký một cách chính thức.

Kỳ hội thảo lần này được tổ chức khá kỹ lưỡng. Lần đầu tiên một khóa đào tạo dành cho các tình nguyện viên được tổ chức. Tội cuộc họp mặt của các thành viên wiki Đài Loan vào mùa đông năm 2006, các tình nguyện viên đã có khóa học ngắn về văn hóa wiki cũng như một số kỹ năng phục vụ cho dự án trong môi trường làm việc quốc tế.

Khoảng 440 đại biểu tham dự đại hội tại Trung tâm Hoạt động Thanh niên Hải ngoại Kiếm Đàm (劍潭海外青年活動中心舉行 Chien Tan Overseas Youth Activity Center, CYOTAC), trong đó hơn nửa là người Đài Loan.